JAL-629 More help text
[jalview.git] / help / help / html / features / clarguments.html
index 99d4611..20c8619 100644 (file)
     <td>Set <code>&#8209;&#8209;substitutions</code> to be initially enabled (or initially disabled).</td>
     </tr>
 
+<!--
+    <tr valign="top">
+    <td><code>&#8209;&#8209;threads <em>NUMBER</em></code></td>
+    <td>When opening multiple alignment windows, set a limit of <em>NUMBER</em> alignments being processed at one time.  The default is 3.</td>
+-->
+
+    </tr>
+
     <tr valign="top">
     <td><code>&#8209;&#8209;jvmmempc=<em>PERCENT</em></code></td>
     <td>
-      <em>Only available with standalone executable jar or jalview.bin.Launcher.</em>
-      <br/>
-      Limit maximum heap size (memory) to PERCENT% of total physical memory detected.
+      Limit maximum heap size (memory) to <em>PERCENT</em>% of total physical memory detected.
       This defaults to 90 if total physical memory can be detected.
       <br/>
       The equals sign ("=") separator must be used with no spaces.
     <tr valign="top">
     <td><code>&#8209;&#8209;jvmmemmax=<em>MAXMEMORY</em></code></td>
     <td>
-      <em>Only available with standalone executable jar or jalview.bin.Launcher.</em>
-      <br/>
-      Limit maximum heap size (memory) to MAXMEMORY. MAXMEMORY can be specified in bytes, kilobytes(k), megabytes(m),
+      Limit maximum heap size (memory) to <em>MAXMEMORY</em>. <em>MAXMEMORY</em> can be specified in bytes, kilobytes(k), megabytes(m),
       gigabytes(g) or if you're lucky enough, terabytes(t).
       This defaults to 32g if total physical memory can be detected, or to 8g if total physical memory cannot be detected.
       <br/>