Merge branch 'develop' into spike/JAL-4047/JAL-4048_columns_in_sequenceID
[jalview.git] / help / help / html / features / featuresFormat.html
index 0e35e49..a2536e2 100755 (executable)
@@ -42,7 +42,7 @@
   
   <ul>
     <li>from the command line <pre>
-<strong> -features &lt;<em>Features filename</em>&gt;</strong>
+<strong> --features &lt;<em>Features filename</em>&gt;</strong>
 </pre>
     </li>
 
   </p>
   <p>Feature attributes can be included as <code>name=value</code> pairs in GFF3 column 9, including <em>(since Jalview 2.11.1.0)</em> 'nested' sub-attributes, for example:
   <br><code>alleles=G,A,C;AF=6;CSQ=SIFT=deleterious,tolerated,PolyPhen=possibly_damaging(0.907)</code>
-  <br>where <code>SIFT</code> and <code>PolyPhen</code> are sub-attributes of <code>CSQ</code>. This data is preserved if features are output in GFF format (but not, currently,
+  <br>where <code>SIFT</code> and <code>PolyPhen</code> are sub-attributes of <code>CSQ</code>. This data is preserved if features are exported in GFF format (but not, currently,
   in Jalview format).
   </p>
   <p>