JAL-3567 JAL-3407 document sequence features report and the additional info provided...
[jalview.git] / help / help / html / menus / popupMenu.html
index 7625606..9c65e1a 100755 (executable)
   <p>
     <strong>Popup Menu</strong><br> <em>This menu is visible
       when right clicking either within a selected region on the
-      alignment or on a selected sequence name. It may not be accessible
+      alignment, on a sequence name, and also when right-clicking a sequence feature. It may not be accessible
       when in 'Cursor Mode' (toggled with the F2 key).</em><br /> <em><strong>Mac
         Users:</strong> pressing CTRL whilst clicking the mouse/track pad is the
       same as a right-click. See your system's settings to configure
       your track-pad's corners to generate right-clicks.</em>
   </p>
   <ul>
-    <li><strong>Selection</strong>
+    <li><strong>Selection<br/></strong>
+    <em>This menu is only visible when right-clicking a selected sequence or region of the alignment. </em>
       <ul>
         <li><a name="sqreport"><strong>Sequence
               Details...<br>
         according to gaps in just the current sequence)</em></li>
     <li><strong>Hide Sequences</strong><br> <em>Hides the
         currently selected sequences in this alignment view.</em><strong><br>
-    </strong></li>
+    </strong><br/>&nbsp;<br/></li>
+    
+    <li><strong><a name="featuredetails"> Feature Details</a><br /></strong>
+    <em>Each entry opens a <a
+      href="../features/seqfeaturereport.html">Sequence Feature
+        Report</a> for visible features under the mouse.<br />Only visible
+      when right-clicking a region where <a
+      href="../features/seqfeatures.html">Sequence Features</a> are
+      shown.
+    </em>
+  </li>
   </ul>
+  
 </body>
 </html>