JAL-3407 release notes for JAL-3375
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index 13e2ae8..bb4b386 100755 (executable)
@@ -62,7 +62,15 @@ li:before {
       <td align="left" valign="top">
         <ul>
           <li>
-            <!-- -->
+            <!-- JAL-3376 -->Record &quot;fixed column&quot; values POS, ID, QUAL, FILTER from VCF as Feature Attributes
+          </li>
+          <li>
+            <!-- JAL-3375 -->More robust VCF numeric data field validation
+            while parsing (e.g. AF* attributes)
+          </li>
+          
+          <li>
+          <!-- JAL -->
           </li>
         </ul> <em>Release processes</em>
         <ul>
@@ -86,10 +94,13 @@ li:before {
             <!-- -->
           </li>
           <li>
-            <!-- -->
+            <!-- JAL-3377 -->Alignment is misaligned in wrapped mode
+            with annotation and exceptions thrown when only a few
+            columns shown in wrapped mode
           </li>
           <li>
-            <!-- -->
+            <!-- JAL-3386 -->Sequence IDs missing in headless export of
+            wrapped alignment figure with annotations
           </li>
           <li>
             <!-- JAL-3388-->Sorting Structure Chooser table by Sequence
@@ -123,6 +134,19 @@ li:before {
             repository
           </li>
         </ul>
+        <em>New Known Issues</em>
+        <ul>
+          <li>
+            <!-- JAL-3523 -->OSX - Current working directory not
+            preserved when Jalview.app launched with parameters from
+            command line
+          </li>
+          <li>
+            <!--  JAL-3525 -->Sequence IDs aligned to wrong margin and
+            clipped in headless figure export when Right Align option
+            enabled
+          </li>
+        </ul>
       </td>
     </tr>
     <tr>