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JAL-913; Extending documentation; VARNA help;
[jalview.git] / help / html / calculations / consensus.html
diff --git a/help/html/calculations/consensus.html b/help/html/calculations/consensus.html
index dfb568e..74bf247 100644 (file)
--- a/help/html/calculations/consensus.html
+++ b/help/html/calculations/consensus.html
@@ -1,6 +1,6 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6.1)
  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
  * 
  * This file is part of Jalview.
@@ -30,6 +30,12 @@
 <p>Select the <strong>&quot;Copy Consensus Sequence&quot;</strong> entry from 
 the consensus annotation label to copy the alignment's consensus sequence to the 
 clipboard. 
+
+<p><strong>Sequence logo</strong></p> 
+By clicking on the label you can also activate the sequence logo. It
+indicates the relative amount of residues per column which can be
+estimated by it's size in the logo. The tooltip of a column gives the
+exact numbers for all occuring residues.
 </p>
 </body>
 </html>