Merge branch 'releases/Release_2_11_3_Branch'

[jalview.git] / help / html / colourSchemes / pid.html
diff --git a/help/html/colourSchemes/pid.html b/help/html/colourSchemes/pid.html

deleted file mode 100755 (executable)

index 05b464c..0000000
--- a/help/html/colourSchemes/pid.html
+++ /dev/null
@@ -1,50 +0,0 @@
-<html>
-<!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
- * 
- * This file is part of Jalview.
- * 
- * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
- * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
- * 
- * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
- * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
- * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
- * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
- * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
--->
-<head><title>Percentage Identity Colour Scheme</title>
-<style type="text/css">
-<!--
-td {
-       text-align: center;
-}
--->
-</style>
-</head>
-
-<body>
-<p><em>PID Colours</em><br>
-  <br>
-  The PID option colours the residues (boxes and/or text) according to the percentage
-  of the residues in each column that agree with the consensus sequence. Only
-  the residues that agree with the consensus residue for each column are coloured.</p>
-<table width="200" border="1">
-  <tr>
-    <td bgcolor="#6464FF">&gt; 80 %</td>
-  </tr>
-  <tr>
-    <td bgcolor="#9999FF">&gt; 60 %</td>
-  </tr>
-  <tr>
-    <td bgcolor="#CCCCFF">&gt; 40%</td>
-  </tr>
-  <tr>
-    <td>&lt; 40%</td>
-  </tr>
-</table>
-</body>
-</html>