2.5.1 release branding
[jalview.git] / help / html / features / codingfeatures.html
index 66edaf9..2b37cad 100644 (file)
@@ -1,3 +1,20 @@
+#-------------------------------------------------------------------------------\r
+# Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5.1)\r
+# Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
+# \r
+# This file is part of Jalview.\r
+# \r
+# Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
+# modify it under the terms of the GNU General Public License \r
+# as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
+# \r
+# Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
+# WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
+# of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
+# PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
+# \r
+# You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
+#-------------------------------------------------------------------------------\r
 <html>\r
 <!--\r
  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)\r
  * \r
  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
 -->\r
+<head>\r
+<title>DNA Sequence Coding Region Definition</title>\r
+</head>\r
+<body>\r
+<p><strong>DNA Sequence Coding Region Definition</strong></p>\r
+<p>Jalview includes the standard DNA codon translation table in\r
+order to be able to dynamically translate cDNA to its expressed\r
+protein sequence. DNA Sequence Coding Regions are sequence \r
+features that can be defined on any DNA sequence in order to\r
+mark stretches of cDNA that will be concatenated to form the\r
+series of codons that are translated by the <strong>&quot;\r
+Calculate&#8594;Translate cDNA&quot;</strong> menu function.    \r
+</p>\r
+</body>\r
+</html>\r