JAL-1544 typos/formatting in help (and Phylip added)
[jalview.git] / help / html / features / dassettings.html
index 2ca2b08..86162dc 100644 (file)
@@ -1,13 +1,32 @@
 <html>
-
+<!--
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
+ * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
 <head>
 <title>DAS Settings</title>
 </head>
 
 <body>
 <p><strong>DAS Settings</strong></p>
-<p>Jalview can retrieve sequences or features from many <a
-       href="http://biodas.org/">DAS</a> sources at once. The DAS sources that
+<p>Jalview can retrieve sequences and features from many <a
+       href="http://biodas.org/">DAS</a> sources. The DAS sources that
 it uses are discovered and selected <em>via</em> the DAS settings panel,
 opened either from the <a href="featuresettings.html">View&#8594;Feature
 Settings</a> dialog box from the alignment window's menu bar, or the <a
@@ -26,7 +45,7 @@ more about these values.
 <p>When the DAS Settings panel is first opened, and when the <strong>'Refresh
 source'</strong> buton is pressed, a list of DAS sources is retrieved from the
 DAS registry URL (set by default to the DAS registration server at
-http://das.sanger.ac.uk/registry/das1/sources/).</p>
+http://www.dasregistry.org/das/).</p>
 <p><strong>Adding your own DAS Sources</strong></p>
 <p>You can add your own DAS source to the list by clicking the
 &quot;Add Local Source&quot; button. Enter the URL and nickname of your