git://source.jalview.org / jalview.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
JAL-1727 added EBI mirror of DAS registry
[jalview.git] / help / html / features / dassettings.html
diff --git a/help/html/features/dassettings.html b/help/html/features/dassettings.html
index b9fe144..90577f0 100644 (file)
--- a/help/html/features/dassettings.html
+++ b/help/html/features/dassettings.html
@@ -1,21 +1,24 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
- * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
- * 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
--->
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
 <head>
 <title>DAS Settings</title>
 </head>
@@ -41,8 +44,10 @@ more about these values.
 <p><strong>Updating the list of sources</strong></p>
 <p>When the DAS Settings panel is first opened, and when the <strong>'Refresh
 source'</strong> buton is pressed, a list of DAS sources is retrieved from the
-DAS registry URL (set by default to the DAS registration server at
-http://das.sanger.ac.uk/registry/das1/sources/).</p>
+DAS registry URL. Note that the registry hosted at http://www.dasregistry.org/das/ was retired at the start of 2015.
+An alternative service is currently hosted at http://www.ebi.ac.uk/das-srv/registry/das/. To connect to this service, ensure your .jalview_properties file includes the following line:<br>
+<b>DAS_REGISTRY_URL=http\://www.ebi.ac.uk/das-srv/registry/das/</b>
+</p>
 <p><strong>Adding your own DAS Sources</strong></p>
 <p>You can add your own DAS source to the list by clicking the
 &quot;Add Local Source&quot; button. Enter the URL and nickname of your