JAL-1500 JAL-1265 patch to parse PDB database refs in PFAM stockholm
[jalview.git] / help / html / features / featuresettings.html
index 9526ed5..63217ee 100755 (executable)
@@ -1,22 +1,24 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.1)
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
  *  
  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
--->
+ -->
 <head>
 <title>Sequence Feature Settings Dialog Box</title>
 </head>
@@ -40,13 +42,12 @@ on its colour box.</em></strong></p>
        <p>
                <a name="selectbyfeature"><strong><em>Selecting
                                        alignment columns by feature</em></strong></a><br> <strong>Double-clicking
-                       a feature type</strong> allows you to select columns in the alignment that
-               contain (or do not contain) features of that type. If a region of the
-               alignment is currently selected, then only features in the current
-               selection will be searched. The following keys affect the way in which
-               selections are made:
-       
-       <ul>
+                       a feature type</strong> in the <strong>Feature
+                       Settings</strong> dialog allows you to select columns in the
+               alignment that contain (or do not contain) features of that type. If a
+               region of the alignment is currently selected, then only features in
+               the current selection will be searched. The following keys affect the
+               way in which selections are made:<ul>
                <li>Hold down <strong>Alt</strong> to select columns not
                        containing features of a particular type.
                </li>