2.5.1 release branding
[jalview.git] / help / html / features / jalarchive.html
index e18e273..9b8906c 100755 (executable)
@@ -1,3 +1,20 @@
+#-------------------------------------------------------------------------------
+# Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5.1)
+# Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+# 
+# This file is part of Jalview.
+# 
+# Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+# modify it under the terms of the GNU General Public License 
+# as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+# 
+# Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+# WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+# of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+# PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+# 
+# You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+#-------------------------------------------------------------------------------
 <html>
 <!--
  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
  * 
  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
 -->
+<head>
+<title>Jalview Archives</title>
+</head>
+<body>
+
+<p><strong>Jalview Project Archives</strong>
+</p>
+
+<p>These are java archives of an XML file containing alignments, trees and Jalview 
+  display information. A data exchange standard is currently being developed, 
+  so there is no stable schema yet, but Jalview web services will soon make use 
+  of the same interchange format.</p>
+<p>For those who want to know...<br>
+  Jalview uses java classes automatically created using <a href="http://www.castor.org">Castor</a>. 
+  Jalview 2.08 uses descriptor classes which significantly increase the speed 
+  of marshalling / unmarshalling java objects into XML. Files created prior to 
+  Jalview 2.08 can still be read in, but they will be saved in the new format. 
+</p>
+</body>
+</html>