git://source.jalview.org / jalview.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
JAL-1544 'Jalview' consistently capitalised
[jalview.git] / help / html / features / jmol.html
diff --git a/help/html/features/jmol.html b/help/html/features/jmol.html
index 45e5526..9d0ad11 100644 (file)
--- a/help/html/features/jmol.html
+++ b/help/html/features/jmol.html
@@ -1,7 +1,7 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
- * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -33,7 +33,7 @@ sequence). Jmol is available from the Jalview desktop and should also
 run in the JalviewLite applet, providing the browser supports Java 1.5.
 If Jmol is not available, then the original <a href="pdbviewer.html">internal
 pdb viewer</a> will be used as a fallback.</p>
-<p>The following menu entries are provided for viewing structure data<br>
+<!-- <p>The following menu entries are provided for viewing structure data<br>
   <ul>
     <li>The <strong>&quot;Structure&#8594;View
         Structure&#8594;</strong> submenu allows a single PDB structure to be chosen
@@ -52,7 +52,7 @@ pdb viewer</a> will be used as a fallback.</p>
         Jalview 2.8.1</em></li>
   </ul>
   <br> 
-</p>
+</p> -->
 <p><a name="align"><strong>Superposing structures based
 on their aligned sequences</strong></a><br>
 If several structures are available on the alignment, you may add
@@ -221,7 +221,7 @@ labels, plotting surfaces, and display animation. The 'Set Picking' menu
 controls the behaviour of single and double mouse clicking on the
 structure, and the 'Console' option opens the Jmol scripting console.</p>
 <p>The state of each Jmol display is stored within <a
-       href="jalarchive.html">jalview archives</a> as a Jmol state recovery
+       href="jalarchive.html">Jalview archives</a> as a Jmol state recovery
 script file. This means that any Jmol visualization effects that you add
 beyond those provided by Jalview will be able to be stored and recovered
 along with the displayed alignments in Jalview.</p>