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JAL-1788 updated docs
[jalview.git] / help / html / features / jmol.html
diff --git a/help/html/features/jmol.html b/help/html/features/jmol.html
index 5102679..c81fcc3 100644 (file)
--- a/help/html/features/jmol.html
+++ b/help/html/features/jmol.html
@@ -1,7 +1,7 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
- * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -33,7 +33,7 @@ sequence). Jmol is available from the Jalview desktop and should also
 run in the JalviewLite applet, providing the browser supports Java 1.5.
 If Jmol is not available, then the original <a href="pdbviewer.html">internal
 pdb viewer</a> will be used as a fallback.</p>
-<p>The following menu entries are provided for viewing structure data<br>
+<!-- <p>The following menu entries are provided for viewing structure data<br>
   <ul>
     <li>The <strong>&quot;Structure&#8594;View
         Structure&#8594;</strong> submenu allows a single PDB structure to be chosen
@@ -52,7 +52,7 @@ pdb viewer</a> will be used as a fallback.</p>
         Jalview 2.8.1</em></li>
   </ul>
   <br> 
-</p>
+</p> -->
 <p><a name="align"><strong>Superposing structures based
 on their aligned sequences</strong></a><br>
 If several structures are available on the alignment, you may add
@@ -79,7 +79,7 @@ atoms in the displayed structures.</p>
 and alpha carbon location. Double clicking an atom allows distances to
 be measured from it to any other atom in the structure.</p>
 <p>
-<table>
+<table border="1">
        <tr>
                <td><strong>Action</strong></td>
                <td><strong>Windows</strong></td>
@@ -162,7 +162,7 @@ be measured from it to any other atom in the structure.</p>
     <li><strong>Select all views<br></strong><em>This is only enabled when </em><strong>Select many views</strong><em> is also enabled, and will add all associated views to the set used to colour the structure display.</em>
   </li>
     <li><strong>Invert selection<br></strong><em>This is only enabled when </em><strong>Select many views</strong><em> is also enabled, and will replace the current set of views with any remaining views not currently used to colour the structure display.</em>
-  </li></ul></li>
+  </li></ul></li></ul>
        <li><strong>Colours<br>
        </strong>
        <ul>