2.2 documentation
[jalview.git] / help / html / features / multipleViews.html
index 0df2ec1..e31a06b 100644 (file)
@@ -1,44 +1,44 @@
-<html>\r
-<head>\r
-<title>Multiple Alignment Views</title>\r
-</head>\r
-<body>\r
-<p><strong>Multiple Alignment Views<strong></p>\r
-<p>Multiple alignment views allow's the same alignment to be viewed in\r
-many different ways, either as multiple alignment tabs, or simultaneously in\r
-linked alignment windows. A view is an independent visualization of\r
-the same alignment, so each may have a different ordering, colouring,\r
-row and column hiding and seuqence feature and annotation display\r
-setting, but alignment, feature and annotation edits are common to\r
-all, since this affects the underlying data.\r
-</p>\r
-<p>\r
-A new view is created using the <strong>&quot;View&#8594;New View&quot;</strong> menu item, or by pressing\r
-<strong>Control+T</strong>. A newly created view will be identical to\r
-the view it was created from, but any changes to the way the alignment\r
-is coloured or displayed will only affect the new view.\r
-</p>\r
-<p>A particular view may focus on some specific aspect of an alignment -\r
-for example, hiding all but the region of an alignment containing a\r
-particular domain. <strong>Right-clicking</strong> a view's tab opens\r
-the View Name dialog box, allowing it to be renamed to something more\r
-meaningful.\r
-</p>\r
-<p><strong>Viewing Multiple Views Simultaneously</strong></p>\r
-<p>Multiple views of an alignment are, by default, gathered together as tabs\r
-within a single alignment window. They can be viewed simultanously by\r
-pressing <strong>X</strong> (or via\r
-<strong>&quot;View&#8594;Expand&quot;</strong>) to expand each view\r
-into its own linked alignment window. Expanded views are gathered\r
-back into into a single tabbed alignment window by pressing\r
-<strong>G</strong>, or by selecting <strong>&quot;View&#8594;Gather&quot;</strong>).\r
-</p>\r
-<p><strong>Tree Viewers and Multiple Views</strong></p>\r
-<p>A tree calculated on a particular view, or loaded onto it, is by\r
-default associated with just that view. However, the <a\r
-href="../calculations/treeviewer.html">Tree Viewer's</a> \r
-<strong>&quot;View&#8594;Associate leaves&quot;</strong> submenu\r
-allows a tree's view association to be changed to to any or all other\r
-views.</p>\r
-<p><em>Multiple Views were introduced in Jalview 2.2</em></p></body>\r
+<html>
+<head>
+<title>Multiple Alignment Views</title>
+</head>
+<body>
+<p><strong>Multiple Alignment Views<strong></p>
+<p>Multiple alignment views allow's the same alignment to be viewed in
+many different ways, either as multiple alignment tabs, or simultaneously in
+linked alignment windows. A view is an independent visualization of
+the same alignment, so each may have a different ordering, colouring,
+row and column hiding and seuqence feature and annotation display
+setting, but alignment, feature and annotation edits are common to
+all, since this affects the underlying data.
+</p>
+<p>
+A new view is created using the <strong>&quot;View&#8594;New View&quot;</strong> menu item, or by pressing
+<strong>Control+T</strong>. A newly created view will be identical to
+the view it was created from, but any changes to the way the alignment
+is coloured or displayed will only affect the new view.
+</p>
+<p>A particular view may focus on some specific aspect of an alignment -
+for example, hiding all but the region of an alignment containing a
+particular domain. <strong>Right-clicking</strong> a view's tab opens
+the View Name dialog box, allowing it to be renamed to something more
+meaningful.
+</p>
+<p><strong>Viewing Multiple Views Simultaneously</strong></p>
+<p>Multiple views of an alignment are, by default, gathered together as tabs
+within a single alignment window. They can be viewed simultanously by
+pressing <strong>X</strong> (or via
+<strong>&quot;View&#8594;Expand&quot;</strong>) to expand each view
+into its own linked alignment window. Expanded views are gathered
+back into into a single tabbed alignment window by pressing
+<strong>G</strong>, or by selecting <strong>&quot;View&#8594;Gather&quot;</strong>).
+</p>
+<p><strong>Tree Viewers and Multiple Views</strong></p>
+<p>A tree calculated on a particular view, or loaded onto it, is by
+default associated with just that view. However, the <a
+href="../calculations/treeviewer.html">Tree Viewer's</a> 
+<strong>&quot;View&#8594;Associate leaves&quot;</strong> submenu
+allows a tree's view association to be changed to to any or all other
+views.</p>
+<p><em>Multiple Views were introduced in Jalview 2.2</em></p></body>
 </html>
\ No newline at end of file