JAL-1432 updated copyright notices
[jalview.git] / help / html / features / preferences.html
index ca3b32e..e68e44e 100755 (executable)
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 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
- * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.0b1)
+ * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
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  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
 -->
 <head>
 <title>Preferences</title>
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 <body>
 <p><strong>Preferences</strong></p>
+<p>The preferences panel is opened from the Jalview Desktop&rsquo;s <strong><em>Tools</em></strong> menu.</p>
 <p>There are six tabs in the Preferences dialog box:
 <ul>
        <li>The <a href="#visual"><strong>&quot;Visual&quot;</strong>
@@ -87,7 +89,7 @@ be sorted by Id or pairwise identity.</p>
 <p><em>Open file</em> - If this is selected then the default
 alignment file will be opened when Jalview is started. You can change
 the default file by clicking on file name and either typing in the file
-path or selecting it from the file chooser window.</p>
+path or selecting it from the file chooser window.<br/><em>Note: The default example alignment is updated periodically to demonstrate new features in Jalview.</em></p>
 <p><a name="colours"><strong>&quot;Colours&quot; Preferences tab</strong></p>
 <p><em>Alignment Colour</em> - The default colour scheme for a new alignment
 window. If the chosen option is &quot;User Defined&quot; then the last