optional display of database refs and non-positional features
[jalview.git] / help / html / features / search.html
index c1ad561..3d60858 100755 (executable)
@@ -13,21 +13,21 @@ td {
 <p><strong>Search</strong></p>\r
 <p>The search box is displayed by pressing Control and F or\r
   selecting &quot;Find...&quot; from the &quot;Search&quot; menu.</p>\r
-<img src="search.gif" width="339" height="111">\r
+<img src="search.gif" width="339" height="110">\r
 <p>&quot;Find next&quot; will find the next occurence of the specified and adjust \r
   the alignment window view to show it, and &quot;Find all&quot; highlights all \r
   matches for a pattern. The &quot;New Feature&quot; is a quick way to highlight \r
   and group residues matching the specified search pattern throughout the alignment. \r
 <ul>\r
-<li>The search uses regular expressions. (understands a mixture of\r
-  posix and perl style regex - see below for a summary)</li>\r
-<li>Gaps are ignored when matching the query to the sequences in the\r
-  alignment.</li>\r
-<li>The search is applied to both sequences and their IDs but the &quot;Find next&quot;\r
-  and &quot;Find all&quot; buttons only count the sequence matches.</li>\r
-  <li>If a region is selected, then search will <strong>only</strong>\r
-  be performed on that region. </li>\r
+  <li>The search uses regular expressions. (understands a mixture of posix and \r
+    perl style regex - see below for a summary)</li>\r
+  <li>Gaps are ignored when matching the query to the sequences in the alignment.</li>\r
+  <li>The search is applied to both sequences and their IDs but the &quot;Find \r
+    next&quot; and &quot;Find all&quot; buttons only count the sequence matches.</li>\r
+  <li>If a region is selected, then search will <strong>only</strong> be performed \r
+    on that region. </li>\r
   <li>To quickly clear the current selection, press the &quot;Escape&quot; key.</li>\r
+  <li>Tick the &quot;Match Case&quot; box to perform a case sensitive search.</li>\r
 </ul>\r
 <p><strong>Creating Features from Search Results</strong></p>\r
 <p>\r