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Merge branch 'develop' into features/JAL-2094_colourInterface
[jalview.git] / help / html / features / seqmappings.html
diff --git a/help/html/features/seqmappings.html b/help/html/features/seqmappings.html
index 9c20188..b88aefc 100644 (file)
--- a/help/html/features/seqmappings.html
+++ b/help/html/features/seqmappings.html
@@ -1,7 +1,7 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2b1)
- * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -23,20 +23,27 @@
 <title>Mapping Between Different Sequences</title>
 </head>
 <body>
-<p><strong>Mapping Between Different Sequences</strong></p>
-<p>A new feature in Jalview 2.3 is the ability to map between sequences in different 
-  domains, based on alignment, or by the use of explicit mappings provided by 
-  databases. </p>
-<p>The most familiar mapping is the one used to identify
-the coordinates corresponding to a displayed sequence when
-viewing a PDB file associated with a sequence (see 
-<a href="viewingpdbs.html">&quot;Viewing PDB Files&quot;</a> 
-for more information.</p>
-<p>The newest form of mapping supported by Jalview is the 
-correspondence between DNA and protein sequences. This mapping
-can be imported directly from EMBL and EMBLCDS database records 
-retrieved by the <a href="seqfetch.html">Sequence Fetcher</a>, 
-and allows sequence features to be mapped directly from Uniprot 
-das sources to their coding region on EMBL sequence records.
+  <p>
+    <strong>Mapping Between Different Sequences</strong>
+  </p><!--  TODO: review and check if this page is really needed -->
+  <p>A new feature in Jalview 2.3 is the ability to map between
+    sequences in different domains, based on alignment, or by the use of
+    explicit mappings provided by databases.</p>
+  <p>
+    The most familiar mapping is the one used to identify the
+    coordinates corresponding to a displayed sequence when viewing a PDB
+    file associated with a sequence (see <a href="viewingpdbs.html">&quot;Viewing
+      PDB Files&quot;</a> for more information.
+  </p>
+  <p>
+    The newest form of mapping supported by Jalview is the
+    correspondence between DNA and protein sequences. This mapping can
+    be imported directly from EMBL and EMBLCDS database records
+    retrieved by the <a href="seqfetch.html">Sequence Fetcher</a>, and
+    allows sequence features to be mapped directly from UniProt das
+    sources to their coding region on EMBL sequence records.
+  </p>
+  <em><a href="siftsmapping.html">SIFTS Mapping</a> between PDB and
+    UniProt data was introduced in Jalview 2.10</em>
 </body>
 </html>