Reference added
[jalview.git] / help / html / index.html
index 2ad0462..1242248 100755 (executable)
@@ -2,15 +2,20 @@
 <head><title>Home Page</title></head>\r
 \r
 <body>\r
-<p><img src="images/align.gif" width="200" height="80"><font size="4"> <strong>Jalview\r
-  Documentation</strong></font></p>\r
-<p>&nbsp;</p>\r
+<IMG src="align.gif"><font size="4">\r
+<br><br>\r
+<strong>Jalview Documentation</strong></font>\r
+<br><br>\r
 JalView (1999) is a fast Java multiple alignment editor and analysis tool. It\r
-features many of the functions of AMAS, for the analysis of sub-families and the\r
-prediction of functional sites, but is fully interactive.\r
+features many of the functions of <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/Software/Amas/amas.html">AMAS</a>,\r
+for the analysis of sub-families and the prediction of functional sites, but is\r
+fully interactive.\r
 <p></p>\r
 <p> If you use JalView in your work, please cite the bioinformatics paper: </p>\r
-<p>Clamp, M., Cuff, J., Searle, S. M. and Barton, G. J. (2004), &quot;The Jalview\r
-  Java Alignment Editor&quot;, Bioinformatics, 12, 426-7.</p>\r
+<p>Clamp, M., Cuff, J., Searle, S. M. and Barton, G. J. (2004), "The Jalview\r
+  Java Alignment Editor", Bioinformatics, 12, 426-7.</p>\r
+  <br>\r
+  <br>\r
+  For any queries relating to Jalview, contact help@jalview.org\r
 </body>\r
 </html>\r