JAL-1517 svg==scalable :)
[jalview.git] / help / html / menus / alwfile.html
index bf1fed5..63f4aec 100755 (executable)
@@ -1,4 +1,24 @@
 <html>
+<!--
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
+ * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
 <head>
 <title>Alignment Window Menus</title>
 </head>
@@ -8,7 +28,7 @@
 <ul>
        <li><strong>Fetch Sequence</strong><br>
        <em>Shows a dialog window in which you can select known ids from
-       Uniprot, EMBL, EMBLCDS or PDB database using Web Services provided by
+       Uniprot, EMBL, EMBLCDS, PDB, PFAM, or RFAM databases using Web Services provided by
        the European Bioinformatics Institute. See <a
                href="../features/seqfetch.html">Sequence Fetcher</a></em>.</li>
        <li><strong>Add Sequences</strong><em><br>
@@ -43,6 +63,9 @@
                <li><strong>PFAM</strong></li>
        </ul>
        </li>
+       <li><strong>Page Setup ...</strong><br>
+       <em>Open the printing system's Page Setup dialog box, to
+       control page size, layout and orientation.</em></li>
        <li><strong>Print (Control P)<br>
        </strong><em>Jalview will print the alignment using the current fonts and
        colours of your alignment. If the alignment has annotations visible,
@@ -65,6 +88,8 @@
                <li><strong>PNG<br>
                </strong><em>Create a <a href="../io/export.html">Portable Network
                Graphics</a> file from your alignment.</em></li>
+               <li><strong>SVG<br>
+               </strong><em>Create a <a href="../io/export.html">Scalable Vector Graphics</a> file from your alignment for embedding in web pages.</em></li>
        </ul>
        </li>
        <li><strong>Export Features</strong><em><br>