JAL-1503 gui changes (score models, flanking regions, trim retrieved sequences)
[jalview.git] / help / html / menus / alwfile.html
index bf1fed5..bc6c9b1 100755 (executable)
@@ -1,4 +1,22 @@
 <html>
+<!--
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.1)
+ * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
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+ * 
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+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+-->
 <head>
 <title>Alignment Window Menus</title>
 </head>
@@ -8,7 +26,7 @@
 <ul>
        <li><strong>Fetch Sequence</strong><br>
        <em>Shows a dialog window in which you can select known ids from
-       Uniprot, EMBL, EMBLCDS or PDB database using Web Services provided by
+       Uniprot, EMBL, EMBLCDS, PDB, PFAM, or RFAM databases using Web Services provided by
        the European Bioinformatics Institute. See <a
                href="../features/seqfetch.html">Sequence Fetcher</a></em>.</li>
        <li><strong>Add Sequences</strong><em><br>
@@ -43,6 +61,9 @@
                <li><strong>PFAM</strong></li>
        </ul>
        </li>
+       <li><strong>Page Setup ...</strong><br>
+       <em>Open the printing system's Page Setup dialog box, to
+       control page size, layout and orientation.</em></li>
        <li><strong>Print (Control P)<br>
        </strong><em>Jalview will print the alignment using the current fonts and
        colours of your alignment. If the alignment has annotations visible,