page setup entry
[jalview.git] / help / html / menus / alwfile.html
index eb45924..d6d62a8 100755 (executable)
        Add sequences to the visible alignment from file, URL, or cut &
        paste window </em></li>
        <li><strong>Reload</strong><em><br>
-       Reloads the alignment from the original file, if available.<br><strong>Warning:
-       This will delete any edits, analyses and colourings applied since the
-       alignment was last saved, and cannot be undone.</strong></em></li>
+       Reloads the alignment from the original file, if available.<br>
+       <strong>Warning: This will delete any edits, analyses and
+       colourings applied since the alignment was last saved, and cannot be
+       undone.</strong></em></li>
        <li><strong>Save (Control S)</strong><em><br>
        Saves the alignment to the file it was loaded from (if available), in
        the same format, updating the original in place. </em></li>
        open, use the &quot;Files of type:&quot; selection box to determine
        which <a href="../io/index.html">alignment format</a> to save as.</em></li>
        <li><strong>Output to Textbox<br>
-       </strong><em>The alignment will be displayed in plain text in a new window
+       </strong><em>The alignment will be displayed in plain text in a new window,
        which you can &quot;Copy and Paste&quot; using the pull down menu, or
-       your standard operating system copy and paste keys. <br>
+       your standard operating system copy and paste keys. The output window
+       also has a <strong>&quot;New Window&quot;</strong> button to import the
+       (possibly edited) text as a new alignment.<br>
        Select the format of the text by selecting one of the following menu
        items.</em>
        <ul>
@@ -40,6 +43,9 @@
                <li><strong>PFAM</strong></li>
        </ul>
        </li>
+       <li><strong>Page Setup ...</strong><br>
+       <em>Open the printing system's Page Setup dialog box, to
+       control page size, layout and orientation.</em></li>
        <li><strong>Print (Control P)<br>
        </strong><em>Jalview will print the alignment using the current fonts and
        colours of your alignment. If the alignment has annotations visible,
@@ -47,8 +53,8 @@
        the number of residues per line of your alignment will depend on the
        paper width or your alignment window width, whichever is the smaller. </em></li>
        <li><strong>Export Image</strong> <em><br>
-       Creates an alignment graphic with the current view's annotation, alignment
-       background colours and group colours. If the alignment is <a
+       Creates an alignment graphic with the current view's annotation,
+       alignment background colours and group colours. If the alignment is <a
                href="../features/wrap.html">wrapped</a>, the output will also be
        wrapped and will have the same visible residue width as the open
        alignment. </em>