updated menus and rearranged seqfeatures (again)
[jalview.git] / help / html / menus / alwview.html
index 9be2775..d83d105 100755 (executable)
@@ -57,7 +57,7 @@
       displayed below the alignment. The default setting is to display the conservation \r
       calculation, quality calculation and consensus values as bar charts. </em><br>\r
     </li>\r
-    <li><strong>Sequence Features<br>\r
+    <li><strong>Fetch Sequence Features<br>\r
       </strong><em>If the sequence names are Swissprot entries Jalview will use \r
       the names to retrieve <a href="../features/seqfeatures.html">sequence features</a> \r
       from the EBI. Features which are 1 residue in length are coloured red, sequences \r
       Note: The retrieved information will update the sequence start and end labels \r
       if they are incorrect. </em><br>\r
     </li>\r
-    <li><strong>Seqence Settings </strong><em><br>\r
-      <em>If features have been added to the alignment then the priority of rendering \r
-      the features can be altered so that overlapping features can be displayed \r
-      or hidden. See <a href="../features/seqfeatures.html">Sequence Features</a>.</em><br>\r
+    <li><strong>Show Sequence Features</strong><br><em>Show or\r
+        hide sequence features on this alignment.</em></li>\r
+    <li><strong>Seqence Feature Settings...</strong><em><br>\r
+      <em>Control the colour and display of sequence features on the\r
+      alignment. See <a\r
+      href="../features/featuresettings.html">Sequence Feature Settings</a>.</em><br>\r
       </em></li>\r
     <li><strong><a href="../features/overview.html">Overview Window</a><br>\r
       </strong><em>A scaled version of the alignment will be displayed in a small \r