git://source.jalview.org / jalview.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
JAL-1015 documentation for basic HTML sequence annotation report.
[jalview.git] / help / html / menus / popupMenu.html
diff --git a/help/html/menus/popupMenu.html b/help/html/menus/popupMenu.html
index 61063ed..3537781 100755 (executable)
--- a/help/html/menus/popupMenu.html
+++ b/help/html/menus/popupMenu.html
@@ -1,7 +1,7 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
+ * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -28,6 +28,10 @@ not be accessible when in 'Cursor Mode' (toggled with the F2 key).</em></p>
 <ul>
   <li><strong>Selection</strong> 
     <ul>
+      <li><a name="sqreport"><strong>Sequence Details ...<br>
+          </strong></a><em>(Since Jalview 2.8)<br>Open an <a href="../io/exportseqreport.html">HTML report containing the annotation
+            and database cross references</a> normally shown in the sequence's
+            tooltip.</em></li>
       <li><strong>Edit </strong> 
         <ul>
           <li><strong>Copy</strong><br>
@@ -104,7 +108,11 @@ not be accessible when in 'Cursor Mode' (toggled with the F2 key).</em></p>
     </strong><em>This menu is only visible if you right-click on a sequence name. 
     </em> 
     <ul>
-      <li><strong>Edit Name/Description<br>
+      <li><a name="sqreport"><strong>Sequence Details ...<br>
+                                       </strong></a><em>(Since Jalview 2.8)<br>Open an <a href="../io/exportseqreport.html">HTML report containing the annotation
+                                               and database cross references</a> normally shown in the sequence's
+                                               tooltip.</em></li>
+                       <li><strong>Edit Name/Description<br>
         </strong><em>You may edit the name and description of each sequence. A 
         window will be displayed asking for a new sequence name and sequence description 
         to be entered. Press OK to accept your edit. To save sequence descriptions, 
@@ -150,8 +158,8 @@ not be accessible when in 'Cursor Mode' (toggled with the F2 key).</em></p>
       </li>
       <li><strong>View Structure<br>
         </strong><em> If the sequence has an associated PDB file added by one 
-        of the methods described above, Jalview will display a 3D interactive 
-        viewer of the file.<br>
+        of the methods described above, Jalview will open a 3D interactive 
+        view of the file.<br>
         These entries will only be present if the sequence has <a
                        href="../features/viewingpdbs.html">associated PDB structures</a>.</em><br>
       </li>