git://source.jalview.org / jalview.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
JAL-3224 JAL-3225 Some fixes in install4j template and build.gradle, and a correction...
[jalview.git] / help / html / misc / aaproperties.html
diff --git a/help/html/misc/aaproperties.html b/help/html/misc/aaproperties.html
index 8c1e3e0..b53f6ef 100755 (executable)
--- a/help/html/misc/aaproperties.html
+++ b/help/html/misc/aaproperties.html
@@ -19,33 +19,48 @@
  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  -->
-<head><title>Amino Acid Properties</title>
+<head>
+<style>
+body {
+    font-size: 100%;
+}
+table {
+    border: solid;
+    border-collapse: separate;
+}
+th, td {
+    border-style:none;
+    font-family: "Courier New", Courier, mono;
+    font-size: large;
+}
+</style><title>Amino Acid Properties</title>
 </head>
-<body><div align="center">
-<h1>Amino Acid Properties</h1>
-  <img src="properties.gif">
-  <br>
-  <table width="295" border="1" cellspacing="0" cellpadding="0">
-    <tr>
-      <td width="291"><pre><font size="4" face="Courier New, Courier, mono"><strong>ILVCAGMFYWHKREQDNSTPBZX-</strong>
-XXXXXXXXXXX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;X&middot;&middot;&middot;XX Hydrophobic
-&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXXXXXXXXX&middot;XXXXX Polar
-&middot;&middot;XXXX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXXXX&middot;&middot;XX Small
-&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;X&middot;&middot;XX Proline
-&middot;&middot;&middot;&middot;XX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;X&middot;&middot;&middot;&middot;XX Tiny
-XXX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Aliphatic
-&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXXX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Aromatic
-&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Positive
-&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;X&middot;X&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Negative
-&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXXX&middot;X&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Charged</font></pre></td>
-    </tr>
-  </table>
+<body>
+  <div align="center">
+    <h1>Amino Acid Properties</h1>
+    <img src="properties.gif"> <br>
+    <table>
+    <tr><th>ILVCA</th><th>GMFYW</th><th>HKREQ</th><th>DNSTP</th><th>BZX-</th><th></th></tr>
+      <tr><td>XXXXX</td><td>XXXXX</td><td>XX&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;X&middot;</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Hydrophobic</td></tr>
+<tr><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;XX</td><td>XXXXX</td><td>XXXX&middot;</td><td>XXXX</td><td>Polar</td></tr>
+<tr><td>&middot;&middot;XXX</td><td>X&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>XXXXX</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Small</td></tr>
+<tr><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;X</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Proline</td></tr>
+<tr><td>&middot;&middot;&middot;&middot;X</td><td>X&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;X&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Tiny</td></tr>
+<tr><td>XXX&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Aliphatic</td></tr>
+<tr><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;XXX</td><td>X&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Aromatic</td></tr>
+<tr><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>XXX&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Positive</td></tr>
+<tr><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;X&middot;</td><td>X&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Negative</td></tr>
+<tr><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>XXXX&middot;</td><td>X&middot;&middot;&middot;&middot;</td><td>&middot;&middot;XX</td><td>Charged</td></tr>
+    </table>
+    </font>
   </div>
-<p><br>
-   From Livingstone, C. D. and Barton, G. J. (1993), <br>
-  "Protein Sequence Alignments: A Strategy for the Hierarchical Analysis of Residue
-  Conservation", Comp. Appl. Bio. Sci., 9, 745-756. </p>
+  <p>
+    <br> From Livingstone, C. D. and Barton, G. J. (1993), <br>
+    "Protein Sequence Alignments: A Strategy for the Hierarchical
+    Analysis of Residue Conservation", Comp. Appl. Bio. Sci., 9,
+    745-756.
+  </p>
   <br>
-</div>
+  </div>
 </body>
 </html>