JAL-2189 JAL-1705 JAL-1795 ensembl fetching docs
[jalview.git] / help / html / releases.html
index c4a8bab..0837cb0 100755 (executable)
     <tr>
       <td width="60" nowrap>
         <div align="center">
-          <strong><a name="Jalview.2.10.0">2.10.0</a><br /> <em>13/9/2016</em></strong>
+          <strong><a name="Jalview.2.10.0">2.10.0</a><br /> <em>20/9/2016</em></strong>
         </div>
       </td>
       <td><em>General</em>
         <ul>
-            <li><!-- JAL---></li>
+            <li><!-- JAL-2164,JAL-1919,-->Jmol now primary parser for importing structure data to Jalview. Enables mmCIF and better PDB parsing.</li>
             <li><!-- JAL-192 --->Alignment ruler shows positions relative to reference sequence</li>
+            <li><!-- JAL-2202 -->Position/residue shown in status bar when mousing over sequence associated annotation</li>
         </ul> <em>Application</em>
         <ul>
             <li><!-- JAL---></li>
             <li><!--  JAL 1812 -->New 'execute Groovy script' option in an alignment window's Calculate menu</li>
             <li><!--  JAL 1812 -->Allow groovy scripts that call Jalview.getAlignFrames() to run in headless mode</li>
             <li><!-- JAL-1369 --->Store/restore reference sequence in Jalview projects</li>
+            <li><!-- JAL-1803-->Chain codes for a sequence's PDB associations are now saved/restored from project</li>
+            <li><!-- JAL-2183-->Double click on an entry in Jalview's database chooser opens a sequence fetcher</li>
+            <li><!-- JAL-2183-->Free-text search client for UniProt using the UniProt web API</li>
+            
              
         </ul> <em>Applet</em>
         <ul>
@@ -86,6 +91,7 @@
             <li><!-- JAL-2075  -->Hidden columns ignored during feature based tree calculation</li>
             <li><!-- JAL-2065  -->Alignment view stops updating when show unconserved enabled for group on alignment</li>
             <li><!--  JAL-2086  -->Cannot insert gaps into sequence when set as reference</li>
+            <li><!-- JAL-2146 -->Alignment column in status incorrectly shown as &quot;Sequence position&quot; when mousing over annotation</li>
             
           </ul>
           <em>Application</em>
             <li><!--  JAL-1011  -->Columns are suddenly selected in other alignments and views when revealing hidden columns</li>
             <li><!--  JAL-1989  -->Hide columns not mirrored in complement view in a cDNA/Protein splitframe</li>
             <li><!--  JAL-1369 -->Cannot save/restore representative sequence from project when only one sequence is represented</li>
+            
             <!--  may exclude, this is an external service stability issue  JAL-1941 /> RNA 3D structure not added via DSSR service</li> -->
           </ul>
           <em>Applet</em>