new features/resolved for 2.4.1.
[jalview.git] / help / html / releases.html
index dc199d5..3786fc3 100755 (executable)
                </li>
                <li>Non-positional feature URL links are shown in link menu (applet and application)
                </li>
+               <li>Automatic Scrolling option in View menu to display the currently highlighted region of an alignment.
+               </li>
+               <li>Improved VAMSAS synchronization (jalview archive used to preserve views, structures, and tree display settings)
+               </li>
+               <li>Sharing of selected regions between views and with other VAMSAS applications (Experimental feature!)
+               </li>
+               <li>New hidden columns and rows and representatives capabilities in annotations file (in progress - not yet fully implemented)</li>
                </ul>
                </td>
                <td>
                <ul>
                <li>URL links generated for all feature links (bugfix)</li>
                <li>Dasobert generated non-positional feature URL link text excludes the start_end suffix (application)</li>
-               <li>Added URL embedding instructions to features file documentation.</li>   
+               <li>Added URL embedding instructions to features file documentation.</li>
+               <li>Sequences are now validated against EMBL database (broken in Version 2.4.0)</li>
+               <li>Codons containing ambiguous nucleotides translated as 'X' in peptide product</li>
+               <li>Sequence description lines properly shared via VAMSAS</li>
                </ul>
                </td>