documentation (JAL-859, JAL-816, JAL-621)

[jalview.git] / help / html / webServices / clustalw.html
diff --git a/help/html/webServices/clustalw.html b/help/html/webServices/clustalw.html

index 73cf971..81ccc4e 100755 (executable)
--- a/help/html/webServices/clustalw.html
+++ b/help/html/webServices/clustalw.html
@@ -1,6 +1,6 @@
  <html>
  <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6.1)
   * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
   * 
   * This file is part of Jalview.
@@ -15,7 +15,7 @@
   * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
   * 
   * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
---!>
+-->
  <head><title>ClustalW Alignment</title></head>
  <body>
  <p><strong>ClustalW Alignments</strong></p>
@@ -41,5 +41,6 @@ on the selected region, if any, or the whole sequence set:</p>
      Submits the sequences with existing gaps to clustalW, which will preserve 
      existing gaps and re-align those regions which are not optimal. </li>
  </ul>
+<em>As of Jalview 2.6, alignment services accessed via the 'Alignment' submenu should be considered legacy Jalview SOAP services.</em>
  </body>
  </html>