trivial change ("" to new String() in static method)
[jalview.git] / help / html / webServices / jnet.html
index 52d8740..2ce1743 100755 (executable)
@@ -15,8 +15,9 @@ most likely prediction via a jury network. <br>
 sequence alignment profiles to improve protein secondary\r
 structure prediction <em>Proteins</em> <strong>40</strong> 502-511</li></ul>\r
 </p>\r
-The function available from the <strong>Web Service&#8594;Secondary Structure \r
-Prediction&#8594;Muscle Alignment </strong> menu does two different kinds of prediction, \r
+The function available from the <strong>Web Service&#8594;Secondary\r
+Structure Prediction&#8594;JNet Secondary Structure \r
+Prediction</strong> menu does two different kinds of prediction, \r
 dependent upon the currently selected region:</p> \r
 <ul>\r
 <li>If nothing is selected, and the displayed sequences appear to\r
@@ -32,7 +33,7 @@ for homolog detection and prediction.
 <li>If a set of sequences are selected, and they appear to be aligned,\r
 then the alignment will be used for a Jnet prediction on the\r
 <strong>first</strong> sequence selected in the set (that is, the one\r
-that was first clicked on).\r
+nearest the top of the alignment window).\r
 </li>      \r
 </ul>\r
 <p>The result of a JNet prediction for a sequence is a new annotated\r