JAL-1683 replace year/version strings with tokens in source
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index 79320f0..cf914d3 100755 (executable)
@@ -1,21 +1,24 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6.1)
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
- * 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
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+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
 <head>
 <title>JNet Secondary Structure Prediction</title>
 </head>
@@ -107,10 +110,15 @@ The annotation bars below the alignment are as follows:
        invoked to rationalise significantly different primary predictions.</em></li>
 </ul>
 </p>
-<em>As of Jalview 2.6, the Jnet service accessed accessed via the
+       <em>JNet annotation created in Jalview 2.8.2 and later versions
+               can be displayed on other alignments via the <a
+               href="../features/annotation.html#seqannots">Add reference
+                       annotation</a> Sequence ID popup menu option.
+       </em>
+       <em>As of Jalview 2.6, the Jnet service accessed accessed via the
 'Secondary structure prediction' submenu should be considered a legacy
 Jalview SOAP service, and will be replaced in the near future by a
-JABAWS Jnet service.</em>
+JPred4 Rest service.</em>
 
 </body>
 </html>