2.5.1 release branding
[jalview.git] / help / html / webServices / muscle.html
index e18e273..715d8cf 100755 (executable)
@@ -1,6 +1,6 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5.1)
  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
 -->
+<head><title>Muscle Alignment</title></head>
+<body>
+<p><strong>Muscle Alignments</strong></p>
+<p>Muscle is a program for the alignment of many protein sequences.</p>
+<p>
+Edgar, Robert C. (2004), MUSCLE: multiple sequence alignment with high
+accuracy and high throughput<br>
+<em>Nucleic Acids Research</em> <strong>32</strong>(5), 1792-97.</p>
+<p> This alignment method is applied to the selected region, if any, or the whole 
+  sequence set when the <strong>Web Service&#8594;Alignment&#8594;Muscle 
+  Protein Sequence Alignment</strong> menu item is selected. </p>
+</body>
+</html>