JAL-2629 suppress 'Add Database' menu option in favour of file chooser argument
[jalview.git] / help / html / whatsNew.html
index c6389d9..0abd2a7 100755 (executable)
@@ -1,25 +1,50 @@
-<html>\r
-<head>\r
-<title>What's new ?</title>\r
-</head>\r
-<body>\r
-<p><strong>What's new ?</strong></p>\r
-\r
-<p><strong>Jalview Version 2.2.1</strong></p>\r
-<p>Non standard characters can be read and displayed </p>\r
-<p>Annotations/Features can be imported/exported to the applet via textbox </p>\r
-<p>Applet allows editing of sequence/annotation/group name &amp; description </p>\r
-<p>Preference setting to display sequence name in italics </p>\r
-<p>Annotation file format extended to allow Sequence_groups to be defined</p>\r
-<p>&nbsp;</p>\r
-<p><strong>Issues Resolved</strong></p>\r
-<p><br>\r
-  Applet crash under certain Linux OS with Java 1.6 installed </p>\r
-<p>Annotation file export / import bugs fixed </p>\r
-<p>PNG / EPS image output bugs fixed<br>\r
-</p>\r
-<p>&nbsp;</p>\r
-<p>See the <a href="releases.html">Release History</a> page for\r
-details of all new features and resolved issues.</p>\r
-</body>\r
-</html>\r
+<html>
+<!--
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
+<head>
+<title>What's new ?</title>
+</head>
+<body>
+  <p>
+    <strong>What's new in Jalview 2.10.4 ?</strong>
+  </p>
+  <p>
+    This is the May 2018 release of Jalview, and the last in the 2.10.x series. Jalview 2.10.4 includes:
+  </p>
+  <ul>
+    <li>Numerous efficiency improvements in the renderer and overview when working with large alignments with lots of hidden columns</li>
+    <li>Use of HTTPS when connecting to Uniprot, Ensembl and other EBI web services</li>
+    <li>Critical patches for running Jalview on OSX with Java 10</li>
+    <li>Easier adjustment of the Alignment ID panel and Annotation panel</li>
+    <li>Improved support for mapping between 3D Structures and Uniprot Protein Sequences</li>
+    <li>Improved support for discovering CDS and transcripts for Proteins and Ensembl gene IDs</li>
+    <li>New buttons on the Structure Chooser for adding structures
+      to an existing view, and disabling automatic superposition
+      according to linked alignments</li>
+    <li>Annotation transfer between Chimera and Jalview <em>(formerly only
+        available in 'Experimental' mode)</em></li>
+  </ul>
+  <p>
+    The full list of bugs fixed in this release can be found in the <a href="releases.html#Jalview.2.10.4">2.10.4
+      Release Notes</a>. 
+  </p>
+</body>
+</html>