git://source.jalview.org / jalview.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
2.2 documentation
[jalview.git] / help / html / whatsNew.html
diff --git a/help/html/whatsNew.html b/help/html/whatsNew.html
index 3af69ae..344c322 100755 (executable)
--- a/help/html/whatsNew.html
+++ b/help/html/whatsNew.html
@@ -1,9 +1,54 @@
-<html>\r
-\r
-<body>\r
-<p><strong>Whats new</strong> </p>\r
-<p>If you can read this then you'll already have seen some of the recent changes\r
-  made to Jalview.<br>\r
-</p>\r
-</body>\r
-</html>\r
+<html>
+<head><title>What's new ?</title></head>
+<body>
+<p><strong>What's new ?</strong> </p>
+
+<p><strong>Jalview Version 2.2</strong></p>
+<p>Multiple views with different styles, colours, hidden regions for one alignment
+</p>
+<p>Easily add, amend and delete sequence features
+</p>
+<p>&quot;Reload&quot; alignment from File or URL to revert to original
+</p>
+<p>&quot;Save&quot; to current filename or &quot;Save As&quot; to new filename
+</p>
+<p>Set different text colour for dark or light background
+</p>
+<p>Right align sequence ids
+</p>
+<p>Set colour of lower case residues in a user defined colour scheme
+</p>
+<p>Menu Rearrangements: New <strong>Format</strong> for alignment layout and <strong>Select</strong> for region selection.
+</p>
+</p><p>Menu item accelerator keys added
+</p>
+<p>Control-V pastes sequences to active window, Control-Shift-V pastes to a new window.
+</p>
+<p>Raise/Minimise alignment and all associated windows from desktop window's <strong>window</strong> menu
+</p>
+<p>Select and colour whole branches of a tree</p>
+<p>'New Window' button on the 'Output to Text box' alignment output
+option to open a new alignment window after editing.</p>
+<p><strong>Issues Resolved</strong></p>
+</p>
+<p>
+Optimisations for large alignments: faster multithreaded calculations and Undo/Redo system.
+</p>
+<p>Remove empty columns - if empty columns exist at the end of the
+alignment bug fixed.
+</p>
+<p>DAS feature fetching slowed down, doesn't overload DAS servers
+</p>
+<p>DAS feature fetching can be cancelled
+</p>
+<p>Correct display of &gt; and &lt; symbols for feature descriptions without explicit &lt;html&gt; tags.
+</p>
+<p>Zoom working in PCA viewer
+</p>
+<p>Sequence Descriptions retained after running a web service
+</p>
+<p>&nbsp;</p>
+<p>See the <a href="releases.html">Release History</a> page for details of all
+  new features and resolved issues. </p>
+</body>
+</html>