Merge branch 'bug/JAL-1610refAnnotationsInViews' into develop
[jalview.git] / help / html / whatsNew.html
index 344c322..4ca6e93 100755 (executable)
@@ -1,54 +1,40 @@
 <html>
-<head><title>What's new ?</title></head>
+<!--
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
+ * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
+<head>
+<title>What's new ?</title>
+</head>
 <body>
-<p><strong>What's new ?</strong> </p>
-
-<p><strong>Jalview Version 2.2</strong></p>
-<p>Multiple views with different styles, colours, hidden regions for one alignment
-</p>
-<p>Easily add, amend and delete sequence features
-</p>
-<p>&quot;Reload&quot; alignment from File or URL to revert to original
-</p>
-<p>&quot;Save&quot; to current filename or &quot;Save As&quot; to new filename
-</p>
-<p>Set different text colour for dark or light background
-</p>
-<p>Right align sequence ids
-</p>
-<p>Set colour of lower case residues in a user defined colour scheme
-</p>
-<p>Menu Rearrangements: New <strong>Format</strong> for alignment layout and <strong>Select</strong> for region selection.
-</p>
-</p><p>Menu item accelerator keys added
-</p>
-<p>Control-V pastes sequences to active window, Control-Shift-V pastes to a new window.
-</p>
-<p>Raise/Minimise alignment and all associated windows from desktop window's <strong>window</strong> menu
-</p>
-<p>Select and colour whole branches of a tree</p>
-<p>'New Window' button on the 'Output to Text box' alignment output
-option to open a new alignment window after editing.</p>
-<p><strong>Issues Resolved</strong></p>
-</p>
-<p>
-Optimisations for large alignments: faster multithreaded calculations and Undo/Redo system.
-</p>
-<p>Remove empty columns - if empty columns exist at the end of the
-alignment bug fixed.
-</p>
-<p>DAS feature fetching slowed down, doesn't overload DAS servers
-</p>
-<p>DAS feature fetching can be cancelled
-</p>
-<p>Correct display of &gt; and &lt; symbols for feature descriptions without explicit &lt;html&gt; tags.
-</p>
-<p>Zoom working in PCA viewer
-</p>
-<p>Sequence Descriptions retained after running a web service
-</p>
-<p>&nbsp;</p>
-<p>See the <a href="releases.html">Release History</a> page for details of all
-  new features and resolved issues. </p>
+       <p>
+               <strong>What's new ?</strong>
+       </p>
+       <p>
+               Jalview 2.8.2 is the first release produced by our new core
+               development team.<br /> It incorporates many minor improvements and
+               bug-fixes, and new features for working with 3D structure data,
+               shading alignments by secondary structure and generation of alignment
+               figures as Scalable Vector Graphics.
+               <br />As ever, the highlights are detailed below, and the full list is
+               given in the
+               <a href="releases.html#Jalview2.8.2">Jalview 2.8.2 Release Notes</a>.
+       </p>
 </body>
 </html>