Merge branch 'bug/JAL-1610refAnnotationsInViews' into develop
[jalview.git] / help / html / whatsNew.html
index bd57b81..4ca6e93 100755 (executable)
@@ -1,30 +1,40 @@
-<html>\r
-<head><title>What's new ?</title></head>\r
-<body>\r
-<p><strong>What's new ?</strong> </p>\r
-<p>Jalview Version 2.07 </p>\r
-<p><a href="features/seqfetch.html">Sequence Fetcher</a> has been added to quickly \r
-  retrieve sequences with known ids from several databases.</p>\r
-<p><a href="features/seqfeatures.html">Sequence Features enhanced</a> to allow \r
-  the user to display all features of a Uniprot file on the alignment and subsequently \r
-  colour, hide or show overlapping features. </p>\r
-<p><a href="io/fileformats.html">Choose to omit /start-end from sequences when \r
-  saving files.</a> This is important for saving files to be used by some programs \r
-  which cannot read the original Jalview sequence output with the appended /start-end.</p>\r
-<p><a href="features/pdbviewer.html">PDB structure viewer enhanced</a>. Mapping \r
-  between sequence and structure has been enhanced, colours on the alignment are \r
-  reflected in the structure viewer.</p>\r
-<p><a href="http://www.jalview.org/examples/applet.html">Jalview Applet can read \r
-  in feature files, PDB files be used as input to HTML form</a> See the website \r
-  to find out the new parameters available for the Applet Version of Jalview.</p>\r
-<p>&nbsp;</p>\r
-<p><strong>Issues Resolved</strong></p>\r
-<p>Group Editing is possible with Control and mouse click. Alt key and mouse press \r
-  does not work as this translates as the middle mouse button, which since 2.04 \r
-  is now used to scroll the alignment and change the font size. </p>\r
-<p>HTML export now writes groups and features which were previously missing.</p>\r
-<p>&nbsp;</p>\r
-<p>See the <a href="releases.html">Release History</a> page for details of all \r
-  new features and resolved issues. </p>\r
-</body>\r
-</html>\r
+<html>
+<!--
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
+ * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
+<head>
+<title>What's new ?</title>
+</head>
+<body>
+       <p>
+               <strong>What's new ?</strong>
+       </p>
+       <p>
+               Jalview 2.8.2 is the first release produced by our new core
+               development team.<br /> It incorporates many minor improvements and
+               bug-fixes, and new features for working with 3D structure data,
+               shading alignments by secondary structure and generation of alignment
+               figures as Scalable Vector Graphics.
+               <br />As ever, the highlights are detailed below, and the full list is
+               given in the
+               <a href="releases.html#Jalview2.8.2">Jalview 2.8.2 Release Notes</a>.
+       </p>
+</body>
+</html>