git://source.jalview.org / jalview.git / blobdiff
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raw | inline | side by side
New method for mapping from common database sources to canonical jalview name. Added...
[jalview.git] / help / html / whatsNew.html
diff --git a/help/html/whatsNew.html b/help/html/whatsNew.html
index 344c322..6989dd4 100755 (executable)
--- a/help/html/whatsNew.html
+++ b/help/html/whatsNew.html
@@ -1,54 +1,26 @@
-<html>
-<head><title>What's new ?</title></head>
-<body>
-<p><strong>What's new ?</strong> </p>
-
-<p><strong>Jalview Version 2.2</strong></p>
-<p>Multiple views with different styles, colours, hidden regions for one alignment
-</p>
-<p>Easily add, amend and delete sequence features
-</p>
-<p>&quot;Reload&quot; alignment from File or URL to revert to original
-</p>
-<p>&quot;Save&quot; to current filename or &quot;Save As&quot; to new filename
-</p>
-<p>Set different text colour for dark or light background
-</p>
-<p>Right align sequence ids
-</p>
-<p>Set colour of lower case residues in a user defined colour scheme
-</p>
-<p>Menu Rearrangements: New <strong>Format</strong> for alignment layout and <strong>Select</strong> for region selection.
-</p>
-</p><p>Menu item accelerator keys added
-</p>
-<p>Control-V pastes sequences to active window, Control-Shift-V pastes to a new window.
-</p>
-<p>Raise/Minimise alignment and all associated windows from desktop window's <strong>window</strong> menu
-</p>
-<p>Select and colour whole branches of a tree</p>
-<p>'New Window' button on the 'Output to Text box' alignment output
-option to open a new alignment window after editing.</p>
-<p><strong>Issues Resolved</strong></p>
-</p>
-<p>
-Optimisations for large alignments: faster multithreaded calculations and Undo/Redo system.
-</p>
-<p>Remove empty columns - if empty columns exist at the end of the
-alignment bug fixed.
-</p>
-<p>DAS feature fetching slowed down, doesn't overload DAS servers
-</p>
-<p>DAS feature fetching can be cancelled
-</p>
-<p>Correct display of &gt; and &lt; symbols for feature descriptions without explicit &lt;html&gt; tags.
-</p>
-<p>Zoom working in PCA viewer
-</p>
-<p>Sequence Descriptions retained after running a web service
-</p>
-<p>&nbsp;</p>
-<p>See the <a href="releases.html">Release History</a> page for details of all
-  new features and resolved issues. </p>
-</body>
-</html>
+<html>\r
+<head>\r
+<title>What's new ?</title>\r
+</head>\r
+<body>\r
+<p><strong>What's new ?</strong></p>\r
+\r
+<p><strong>Jalview Version 2.2.1</strong></p>\r
+<p>Non standard characters can be read and displayed </p>\r
+<p>Annotations/Features can be imported/exported to the applet via textbox </p>\r
+<p>Applet allows editing of sequence/annotation/group name &amp; description </p>\r
+<p>Preference setting to display sequence name in italics </p>\r
+<p>Annotation file format extended to allow Sequence_groups to be defined</p>\r
+<p>Default opening of alignment overview panel can be specified in preferences</p>\r
+<p>&nbsp;</p>\r
+<p><strong>Issues Resolved</strong></p>\r
+<p><br>\r
+  Applet crash under certain Linux OS with Java 1.6 installed </p>\r
+<p>Annotation file export / import bugs fixed </p>\r
+<p>PNG / EPS image output bugs fixed<br>\r
+</p>\r
+<p>&nbsp;</p>\r
+<p>See the <a href="releases.html">Release History</a> page for\r
+details of all new features and resolved issues.</p>\r
+</body>\r
+</html>\r