New method for mapping from common database sources to canonical jalview name. Added...
[jalview.git] / help / html / whatsNew.html
index bd57b81..6989dd4 100755 (executable)
@@ -1,30 +1,26 @@
 <html>\r
-<head><title>What's new ?</title></head>\r
+<head>\r
+<title>What's new ?</title>\r
+</head>\r
 <body>\r
-<p><strong>What's new ?</strong> </p>\r
-<p>Jalview Version 2.07 </p>\r
-<p><a href="features/seqfetch.html">Sequence Fetcher</a> has been added to quickly \r
-  retrieve sequences with known ids from several databases.</p>\r
-<p><a href="features/seqfeatures.html">Sequence Features enhanced</a> to allow \r
-  the user to display all features of a Uniprot file on the alignment and subsequently \r
-  colour, hide or show overlapping features. </p>\r
-<p><a href="io/fileformats.html">Choose to omit /start-end from sequences when \r
-  saving files.</a> This is important for saving files to be used by some programs \r
-  which cannot read the original Jalview sequence output with the appended /start-end.</p>\r
-<p><a href="features/pdbviewer.html">PDB structure viewer enhanced</a>. Mapping \r
-  between sequence and structure has been enhanced, colours on the alignment are \r
-  reflected in the structure viewer.</p>\r
-<p><a href="http://www.jalview.org/examples/applet.html">Jalview Applet can read \r
-  in feature files, PDB files be used as input to HTML form</a> See the website \r
-  to find out the new parameters available for the Applet Version of Jalview.</p>\r
+<p><strong>What's new ?</strong></p>\r
+\r
+<p><strong>Jalview Version 2.2.1</strong></p>\r
+<p>Non standard characters can be read and displayed </p>\r
+<p>Annotations/Features can be imported/exported to the applet via textbox </p>\r
+<p>Applet allows editing of sequence/annotation/group name &amp; description </p>\r
+<p>Preference setting to display sequence name in italics </p>\r
+<p>Annotation file format extended to allow Sequence_groups to be defined</p>\r
+<p>Default opening of alignment overview panel can be specified in preferences</p>\r
 <p>&nbsp;</p>\r
 <p><strong>Issues Resolved</strong></p>\r
-<p>Group Editing is possible with Control and mouse click. Alt key and mouse press \r
-  does not work as this translates as the middle mouse button, which since 2.04 \r
-  is now used to scroll the alignment and change the font size. </p>\r
-<p>HTML export now writes groups and features which were previously missing.</p>\r
+<p><br>\r
+  Applet crash under certain Linux OS with Java 1.6 installed </p>\r
+<p>Annotation file export / import bugs fixed </p>\r
+<p>PNG / EPS image output bugs fixed<br>\r
+</p>\r
 <p>&nbsp;</p>\r
-<p>See the <a href="releases.html">Release History</a> page for details of all \r
-  new features and resolved issues. </p>\r
+<p>See the <a href="releases.html">Release History</a> page for\r
+details of all new features and resolved issues.</p>\r
 </body>\r
 </html>\r