JAL-2280 Improvement to enable drag'n'drop association of mmCIF file structures to...
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
index 80ac9ca..864e34a 100644 (file)
@@ -319,7 +319,6 @@ label.found_match_for = Found match for {0}
 label.font = Font:
 label.size = Size:
 label.style = Style:
-label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
 label.calculating = Calculating....
 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
 label.colour_residues_above_occurence = Colour residues above % occurence
@@ -383,14 +382,14 @@ label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation =
 label.translation_failed = Translation Failed
 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
 label.implementation_error  = Implementation error:
-label.automatically_associate_pdb_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} PDB files with sequences in the alignment that have the same name?
-label.automatically_associate_pdb_files_by_name = Automatically Associate PDB files by name
+label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
+label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
 label.view_name_original = Original
 label.enter_view_name = Enter View Name
 label.enter_label = Enter label
-label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure?
+label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
 label.pdb_entry_is_already_displayed = {0} is already displayed.\nDo you want to re-use this viewer ?
 label.map_sequences_to_visible_window = Map Sequences to Visible Window: {0}
 label.add_pdbentry_to_view = Do you want to add {0} to the view called\n{1}\n
@@ -730,8 +729,8 @@ label.move_url_down = Move URL Down
 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
-label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases. Some of the ids have been\n altered, most likely the start/end residue will have been updated.\n Save your alignment to maintain the updated id.\n\n
-label.sequence_names_updated = Sequence names updated
+label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
+label.sequences_updated = Sequences updated
 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
 label.show_all_chains = Show all chains
 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
@@ -773,7 +772,7 @@ label.select_backgroud_colour = Select Background Colour
 label.invalid_font = Invalid Font
 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
-label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This Searches the entire database)
+label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
@@ -789,7 +788,9 @@ label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
 label.use_sequence_id_1 = Use $SEQUENCE_ID$ or $SEQUENCE_ID=/<regex>/=$
-label.use_sequence_id_2 = \nto embed sequence id in URL
+label.use_sequence_id_2 = to embed sequence id in URL
+label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_NAME$ similarly to embed sequence name
+label.use_sequence_id_4 = 
 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
 label.switch_server = Switch server
 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
@@ -1129,7 +1130,7 @@ status.das_feature_fetching_complete = DAS Feature Fetching Complete
 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
-status.opening_file = opening file
+status.opening_file_for = opening file for
 status.colouring_chimera = Colouring Chimera
 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
 label.font_too_small = Font size is too small