JAL-1553 added help documentation and updated AnnotationColumnChooser to exclude...
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
index 9eee9cc..aafb445 100644 (file)
@@ -107,7 +107,7 @@ action.change_params = Change Parameters
 action.apply = Apply
 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
-action.by_chain = By chain
+action.by_chain = By Chain
 action.by_sequence = By Sequence
 action.paste_annotations = Paste Annotations
 action.format = Format
@@ -248,6 +248,10 @@ label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
 label.structure_viewer = Default structure viewer
+label.chimera_path = Path to Chimera program
+label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
+label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
+label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
 label.min_colour = Minimum Colour
 label.max_colour = Maximum Colour
 label.use_original_colours = Use Original Colours
@@ -341,7 +345,7 @@ label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
 label.select_eps_character_rendering_style = Select EPS character rendering style
 label.invert_selection = Invert Selection
 label.optimise_order = Optimise Order
-label.seq_sort_by_score = Seq sort by Score
+label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
 label.load_colours = Load Colours
 label.save_colours = Save Colours
 label.fetch_das_features = Fetch DAS Features
@@ -435,8 +439,8 @@ label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
 label.user_defined_colours = User defined colours
 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
 label.jaview_build_date = Build date: {0}
-label.jalview_authors_1 = Authors: :  Jim Procter, Andrew Waterhouse, Lauren Lui, Jan Engelhardt, Natasha Sherstnev,
-label.jalview_authors_2 = Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
+label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
+label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
@@ -775,7 +779,9 @@ label.services_at = Services at {0}
 label.rest_client_submit = {0} using {1}
 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
-label.feature_settings_click_drag = <html>Click/drag feature types up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature in alignment/current selection<br/>Pressing Alt will select columns outside features rather than inside<br/>Pressing Shift to modify current selection (rather than clear current selection)<br/>Press CTRL or Command/Meta to toggle columns in/outside features<br/></html>
+#label.feature_settings_click_drag = <html>Click/drag feature types up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature in alignment/current selection<br/>Pressing Alt will select columns outside features rather than inside<br/>Pressing Shift to modify current selection (rather than clear current selection)<br/>Press CTRL or Command/Meta to toggle columns in/outside features<br/></html>
+label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
+label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
@@ -1089,6 +1095,7 @@ warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust
 warn.service_not_supported = Service not supported!
 warn.input_is_too_big = Input is too big!
 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
+warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
@@ -1098,6 +1105,8 @@ info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JNet job result data\!\n{2}
 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
+info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
+info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
@@ -1167,3 +1176,16 @@ label.show_logo = Show Logo
 label.normalise_logo = Normalise Logo
 label.no_colour_selection_in_scheme = Please, make a colour selection before to apply colour scheme
 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
+label.select_by_annotation = Select By Annotation
+action.select_by_annotation = Select by Annotation...
+label.threshold_filter =  Threshold Filter
+action.hide = Hide
+action.select = Select
+label.alpha_helix = Alpha Helix
+label.beta_strand = Beta Strand
+label.turn = Turn
+label.select_all = Select All
+label.structures_filter = Structures Filter
+label.search_filter = Search Filter
+label.display_name = Display Label
+label.description = Description