JAL-2416 amended to (as near as possible) strict NCBI format
[jalview.git] / resources / scoreModel / blosum62.scm
index b793e04..50e74cc 100644 (file)
@@ -1,5 +1,4 @@
 ScoreMatrix BLOSUM62
-ARNDCQEGHILKMFPSTWYVBZX-*
 #
 # The BLOSUM62 substitution matrix, as at https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Class/FieldGuide/BLOSUM62.txt
 # The first line declares a ScoreMatrix with the name BLOSUM62 (shown in menus)
@@ -9,7 +8,6 @@ ARNDCQEGHILKMFPSTWYVBZX-*
 # Values may be integer or floating point, delimited by tab, space, comma or combinations
 #
        A       R       N       D       C       Q       E       G       H       I       L       K       M       F       P       S       T       W       Y       V       B       Z       X       -   *
-#
 A      4       -1      -2      -2      0       -1      -1      0       -2      -1      -1      -1      -1      -2      -1      1       0       -3      -2      0       -2      -1      0       -4 -4
 R      -1      5       0       -2      -3      1       0       -2      0       -3      -2      2       -1      -3      -2      -1      -1      -3      -2      -3      -1      0       -1      -4 -4
 N      -2      0       6       1       -3      0       0       0       1       -3      -3      0       -2      -3      -2      1       0       -4      -2      -3      3       0       -1      -4 -4