JAL-2465 bugfix and rerefactor renamed getPdbFile() method to getStructureFile()
[jalview.git] / src / MCview / AppletPDBCanvas.java
index aac796c..0f3da69 100644 (file)
@@ -158,7 +158,7 @@ public class AppletPDBCanvas extends Panel implements MouseListener,
 
     try
     {
-      pdb = ssm.setMapping(seq, chains, pdbentry.getFile(), protocol);
+      pdb = ssm.setMapping(seq, chains, pdbentry.getFile(), protocol, null);
 
       if (protocol == DataSourceType.PASTE)
       {
@@ -1125,7 +1125,7 @@ public class AppletPDBCanvas extends Panel implements MouseListener,
   // ////////////////////////////////
   // /StructureListener
   @Override
-  public String[] getPdbFile()
+  public String[] getStructureFiles()
   {
     return new String[] { pdbentry.getFile() };
   }