JAL-1807 add j2s nature to project
[jalview.git] / src / MCview / PDBCanvas.java
index 406d9f1..9a7c3c2 100644 (file)
  */
 package MCview;
 
+import jalview.analysis.AlignSeq;
+import jalview.datamodel.PDBEntry;
+import jalview.datamodel.SequenceI;
+import jalview.gui.AlignmentPanel;
+import jalview.gui.FeatureRenderer;
+import jalview.gui.SeqCanvas;
+import jalview.gui.SequenceRenderer;
+import jalview.io.AppletFormatAdapter;
+import jalview.structure.AtomSpec;
+import jalview.structure.StructureListener;
+import jalview.structure.StructureMapping;
+import jalview.structure.StructureSelectionManager;
+
 import java.awt.Color;
 import java.awt.Dimension;
 import java.awt.Event;
@@ -41,17 +54,6 @@ import java.util.Vector;
 import javax.swing.JPanel;
 import javax.swing.ToolTipManager;
 
-import jalview.analysis.AlignSeq;
-import jalview.datamodel.PDBEntry;
-import jalview.datamodel.SequenceI;
-import jalview.gui.AlignmentPanel;
-import jalview.gui.FeatureRenderer;
-import jalview.gui.SequenceRenderer;
-import jalview.structure.AtomSpec;
-import jalview.structure.StructureListener;
-import jalview.structure.StructureMapping;
-import jalview.structure.StructureSelectionManager;
-
 public class PDBCanvas extends JPanel implements MouseListener,
         MouseMotionListener, StructureListener
 {
@@ -115,7 +117,7 @@ public class PDBCanvas extends JPanel implements MouseListener,
 
   Font font = new Font("Helvetica", Font.PLAIN, 10);
 
-  jalview.gui.SeqCanvas seqcanvas;
+  SeqCanvas seqcanvas;
 
   public SequenceI[] sequence;
 
@@ -152,7 +154,7 @@ public class PDBCanvas extends JPanel implements MouseListener,
     {
       pdb = ssm.setMapping(seq, chains, pdbentry.getFile(), protocol);
 
-      if (protocol.equals(jalview.io.AppletFormatAdapter.PASTE))
+      if (protocol.equals(AppletFormatAdapter.PASTE))
       {
         pdbentry.setFile("INLINE" + pdb.id);
       }