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[jalview.git] / src / jalview / api / AlignCalcWorkerI.java
index 06dc054..b51b94e 100644 (file)
  */
 package jalview.api;
 
+import java.util.concurrent.Callable;
+
 import jalview.datamodel.AlignmentAnnotation;
 
 /**
  * Interface describing a worker that calculates alignment annotation(s). The
  * main (re-)calculation should be performed by the inherited run() method.
  */
-public interface AlignCalcWorkerI extends Runnable
+public interface AlignCalcWorkerI
 {
   /**
    * Answers true if this worker updates the given annotation (regardless of its
@@ -35,17 +37,32 @@ public interface AlignCalcWorkerI extends Runnable
    * @param annot
    * @return
    */
-  public boolean involves(AlignmentAnnotation annot);
+  boolean involves(AlignmentAnnotation annot);
 
   /**
    * Updates the display of calculated annotation values (does not recalculate
-   * the values). This allows for quick redraw of annotations when display
+   * the values). This allows a quick redraw of annotations when display
    * settings are changed.
    */
-  public void updateAnnotation();
+  void updateAnnotation();
 
   /**
-   * Removes any annotation managed by this worker from the alignment
+   * Removes any annotation(s) managed by this worker from the alignment
    */
   void removeAnnotation();
+  
+  /**
+   * The main calculation happens here
+   * @throws Throwable 
+   */
+  public void run() throws Throwable;
+  
+  /**
+   * Answers true if the worker should be deleted entirely when its annotation
+   * is deleted from the display, or false if it should continue to run. Some
+   * workers are required to run for their side-effects.
+   * 
+   * @return
+   */
+  boolean isDeletable();
 }