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[jalview.git] / src / jalview / appletgui / ExtJmol.java
index b3d1a3c..bbddd26 100644 (file)
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 /*
  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
- * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -48,7 +48,8 @@ public class ExtJmol extends JalviewJmolBinding
           PDBEntry[] pdbentry, SequenceI[][] seq, String[][] chains,
           String protocol)
   {
-    super(alframe.alignPanel.getStructureSelectionManager(), pdbentry, seq, chains, protocol);
+    super(alframe.alignPanel.getStructureSelectionManager(), pdbentry, seq,
+            chains, protocol);
   }
 
   public ExtJmol(JmolViewer viewer, AlignmentPanel alignPanel,
@@ -74,7 +75,7 @@ public class ExtJmol extends JalviewJmolBinding
 
   public FeatureRenderer getFeatureRenderer(AlignmentViewPanel alignment)
   {
-    AlignmentPanel ap = (AlignmentPanel)alignment;
+    AlignmentPanel ap = (AlignmentPanel) alignment;
     if (ap.av.showSequenceFeatures)
     {
       return ap.getFeatureRenderer();
@@ -87,7 +88,7 @@ public class ExtJmol extends JalviewJmolBinding
 
   public SequenceRenderer getSequenceRenderer(AlignmentViewPanel alignment)
   {
-    return ((AlignmentPanel)alignment).getSequenceRenderer();
+    return ((AlignmentPanel) alignment).getSequenceRenderer();
   }
 
   public void notifyScriptTermination(String strStatus, int msWalltime)
@@ -189,7 +190,7 @@ public class ExtJmol extends JalviewJmolBinding
   public void releaseReferences(Object svl)
   {
     // TODO Auto-generated method stub
-    
+
   }
 
 }