JAL-957 manual update to applet authorlist - need to use authorprops (JAL-1200)
[jalview.git] / src / jalview / appletgui / FeatureSettings.java
index de9d231..db7d9b3 100755 (executable)
@@ -1,13 +1,13 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
- * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
+ * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
  * 
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- * 
+ *  
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  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
@@ -263,7 +263,8 @@ public class FeatureSettings extends Panel implements ItemListener,
       rdrw = true;
       groupPanel.removeAll();
     }
-    // TODO: JAL-964 - smoothly incorporate new group entries if panel already displayed and new groups present
+    // TODO: JAL-964 - smoothly incorporate new group entries if panel already
+    // displayed and new groups present
     Enumeration gps = fr.featureGroups.keys();
     while (gps.hasMoreElements())
     {
@@ -291,7 +292,7 @@ public class FeatureSettings extends Panel implements ItemListener,
     SequenceFeature[] tmpfeatures;
     String group = null, type;
     Vector visibleChecks = new Vector();
-    AlignmentI alignment=av.getAlignment();
+    AlignmentI alignment = av.getAlignment();
     for (int i = 0; i < alignment.getHeight(); i++)
     {
       if (alignment.getSequenceAt(i).getSequenceFeatures() == null)