reveal = null;
for (int[] region : av.getAlignment().getHiddenColumns()
- .getListOfCols())
+ .getHiddenRegions())
{
if (res + 1 == region[0] || res - 1 == region[1])
{
if (av.getShowHiddenMarkers())
{
int widthx = 1 + endx - startx;
- for (int i = 0; i < hidden.getListOfCols().size(); i++)
+ for (int i = 0; i < hidden.getHiddenRegions().size(); i++)
{
res = hidden.findHiddenRegionPosition(i) - startx;