false, 0, av.alignment.getWidth());\r
\r
\r
- if (av.getGlobalColourScheme().conservationApplied())\r
- {\r
+ if ( av.getGlobalColourScheme()!=null\r
+ && av.getGlobalColourScheme().conservationApplied())\r
+ {\r
Conservation c = new Conservation("Group",\r
ResidueProperties.propHash, 3,\r
sg.sequences, sg.getStartRes(),\r