RepresentGroup count items
[jalview.git] / src / jalview / datamodel / AlignmentI.java
index 4e5987d..71ba3e0 100755 (executable)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*
 * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
-* Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
+* Copyright (C) 2006 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
 *
 * This program is free software; you can redistribute it and/or
 * modify it under the terms of the GNU General Public License
@@ -107,6 +107,7 @@ public interface AlignmentI
      */
     public void deleteSequence(int i);
 
+
     /**
      * Deletes all residues in every sequence of alignment within given columns.
      *
@@ -159,7 +160,7 @@ public interface AlignmentI
      * @param shiftrecord
      */
     public void removeGaps(ShiftList shiftrecord);
-    
+
     /**
      * Finds group that given sequence is part of.
      *
@@ -242,12 +243,6 @@ public interface AlignmentI
      */
     public char getGapCharacter();
 
-    /**
-     * DOCUMENT ME!
-     *
-     * @return DOCUMENT ME!
-     */
-    public Vector getAAFrequency();
 
     /**
      * Returns true if alignment is nucleotide sequence