Merge branch 'develop' into bug/JAL-2154projectMappings
[jalview.git] / src / jalview / datamodel / DBRefSource.java
index 8783e4f..fba9211 100755 (executable)
@@ -23,7 +23,10 @@ package jalview.datamodel;
 /**
  * Defines internal constants for unambiguous annotation of DbRefEntry source
  * strings and describing the data retrieved from external database sources (see
- * jalview.ws.DbSourcProxy)
+ * jalview.ws.DbSourcProxy) <br/>
+ * TODO: replace with ontology to allow recognition of particular attributes
+ * (e.g. protein coding, alignment (ortholog db, paralog db, domain db),
+ * genomic, transcriptomic, 3D structure providing (PDB, MODBASE, etc) ..).
  * 
  * @author JimP
  * 
@@ -83,6 +86,8 @@ public class DBRefSource
    */
   public static final String ENSEMBL = "ENSEMBL";
 
+  public static final String ENSEMBLGENOMES = "ENSEMBLGENOMES";
+
   /**
    * List of databases whose sequences might have coding regions annotated
    */