fix for JAL-2419 - don’t trash the current selection
[jalview.git] / src / jalview / gui / AppJmolBinding.java
index 6e520e5..75e0c5e 100644 (file)
@@ -21,6 +21,7 @@
 package jalview.gui;
 
 import jalview.api.AlignmentViewPanel;
+import jalview.api.structures.JalviewStructureDisplayI;
 import jalview.bin.Cache;
 import jalview.datamodel.PDBEntry;
 import jalview.datamodel.SequenceI;
@@ -42,10 +43,9 @@ public class AppJmolBinding extends JalviewJmolBinding
   private FeatureRenderer fr = null;
 
   public AppJmolBinding(AppJmol appJmol, StructureSelectionManager sSm,
-          PDBEntry[] pdbentry, SequenceI[][] sequenceIs, String[][] chains,
-          DataSourceType protocol)
+          PDBEntry[] pdbentry, SequenceI[][] sequenceIs, DataSourceType protocol)
   {
-    super(sSm, pdbentry, sequenceIs, chains, protocol);
+    super(sSm, pdbentry, sequenceIs, protocol);
     appJmolWindow = appJmol;
   }
 
@@ -209,4 +209,10 @@ public class AppJmolBinding extends JalviewJmolBinding
     // TODO Auto-generated method stub
     return null;
   }
+
+  @Override
+  public JalviewStructureDisplayI getViewer()
+  {
+    return appJmolWindow;
+  }
 }