JAL-3915 remove RNAview opts from preferences. Still present in config file ready...
[jalview.git] / src / jalview / gui / Desktop.java
index 666fb4e..0f80dd5 100644 (file)
@@ -551,7 +551,8 @@ public class Desktop extends jalview.jbgui.GDesktop
     if (Cache.getDefault(Preferences.ADD_SS_ANN, true)) {
       ssm.setAddTempFacAnnot(Cache.getDefault(Preferences.ADD_TEMPFACT_ANN, true));
       ssm.setProcessSecondaryStructure(Cache.getDefault(Preferences.STRUCT_FROM_PDB, true));
-      ssm.setSecStructServices(Cache.getDefault(Preferences.USE_RNAVIEW, true));
+      // JAL-3915 - RNAView is no longer an option so this has no effect
+      ssm.setSecStructServices(Cache.getDefault(Preferences.USE_RNAVIEW, false));
     } else {
       ssm.setAddTempFacAnnot(false);
       ssm.setProcessSecondaryStructure(false);